缺点是有一定的手术死亡率(0.2%)，以及某些手术并发症，还有可能在术后局部发生出血，须警惕引起窒息。术中易伤及喉返神经或喉上神经，影响发音。若切除了甲状旁腺或影响其血液供应时，引起暂时性或永久性手足抽搐症。少数术前未妥善准备者可诱发甲亢危象。少数病例可并发甲状腺功能减退症。有些患者对外科手术存有较大顾虑或恐惧心理，则宜选择药物治疗或放射性碘疗法。
