便秘一般分为两类：器质性便秘，是由各种疾病所引起的；功能性便秘，多为损伤、药物以及不良生活、排便习惯所致。临床上所说的慢性顽固性便秘，指病程超过两年，经药物及各种非手术治疗难以奏效，而需要手术治疗者。原发性便秘指病因不清，治疗困难者；继发性便秘为先天性疾病损伤、药物以及手术等引起的。
临床上为指导治疗而常用的分类如下：
